NGS Lymfoid Panel

Print

Beschrijving van de test

Naam:
NGS Lymfoid Panel
Synoniemen:
NGS lymphoid lymfoid panel T lymfoom B lymfomen
Aanvraag code:
MOBI
Frequentie:
wekelijks
Uitvoerend labo:
AZ Sint Jan
TAT:
3 weken
Accreditatie:
ISO 15189:2012 (379-MED)
Verantwoordelijke bioloog:
dr. Helena Devos

Afname van het materiaal

Afname:
Beenmerg, perifeer bloed
Toegelaten materiaal:
Biopt klier, weefselbiopt, FFPE
Toegelaten recipiënt:
EDTA, steriel recipiënt (biopt)
Volume:
2 mL beenmerg, 2 mL bloed (volstaat voor alle aangevraagde DNA analyses)

Criteria voor aanvaarding of bijaanvraag

Acceptatie:
Bewaar bij 2-8°C (niet invriezen), Verzending naar laboratorium mag bij kamertemperatuur.

Indien overnacht bewaring biopt: fysiologisch water toevoegen

Bijaanvraag:
max 21 dagen na afname indien nog geen DNA beschikbaar, max 2 jaar na afname indien reeds DNA beschikbaar

Analyse

Analysemethode:
Next generation sequencing - Targeted resequencing Qiagen QiaSeq Targeted DNA custom panel
IVDR status:
LDT: in huis ontwikkelde in-vitro diagnostiek
Deelname EKE:
UKNEQAS
Interpretatie:
High throughput sequencing van 51 genen (Qiaseq lymfoid custom panel) betrokken in de pathogenese van zowel B als T lymfomen wordt aangewend voor diagnostische, prognostische en therapeutische oppuntstelling van ingewikkelde klinische lymfoom casussen na MOC bepreking en/of in overleg met een klinisch bioloog. Varianten tot een waargenomen allel frequentie van 2% worden gerapporteerd. De gevoeligheid van de analyse is minstens 5% allel frequentie voor substitutievarianten en kleine indels (< 25 bp). Grote indels vertonen een verminderde gevoeligheid. Deze analyse kan geen onderscheid maken tussen een verworven en een germline variant. Classificatie van varianten uit het ComPerMed genenpanel gebeurt volgens de Belgische richtlijnen, varianten uit de overige genen worden geclassificeerd a.d.h.v. VarSome en literatuur.

Volgende regio’s worden geanalyseerd:

GenExon(en)Transcript
ARID1A1 - 20ENST00000324856.7
B2M1 - 3ENST00000349264.6
BCL21 - 2ENST00000398117.1
BIRC34 - 10ENST00000532808.1
BRAF15ENST00000288602.6
BTK15ENST00000308731.7
CARD114 - 10ENST00000396946.4
CCND11ENST00000227507.2
CD281 - 4ENST00000324106.8
CD581 - 6ENST00000369489.5
CD79A4 - 5ENST00000221972.3
CD79B5 - 6ENST00000392795.3
CDKN2A1 - 2ENST00000361570.3
CREBBP1 - 31ENST00000262367.5
CXCR42 partieel (A307-S352)ENST00000241393.3
DDX3X1 - 17ENST00000399959.2
DNMT3A8 - 23ENST00000321117.5
EP3001 - 31ENST00000263253.7
EZH22 - 20ENST00000320356.2
FBXW78 - 10ENST00000281708.4
FOXO11 - 2ENST00000379561.5
GNA131 - 4ENST00000439174.2
ID31 - 2ENST00000374561.5
IDH24ENST00000330062.3
JAK310 - 19ENST00000458235.1
KLF21 - 3ENST00000248071.5
KRAS2 - 5ENST00000311936.3
MAP2K12 - 3ENST00000307102.5
MEF2B2 - 9ENST00000424583.2
MYC1 - 3ENST00000377970.2
MYD883 - 5ENST00000417037.2
NFKBIE1 - 6ENST00000275015.5
NOTCH126, 27, 34ENST00000277541.6
NOTCH234ENST00000256646.2
NRAS2 - 3ENST00000369535.4
PIM11 - 6ENST00000373509.5
PLCG11, 11, 29ENST00000373272.2
PLCG219, 20, 22, 24, 26, 27ENST00000359376.3
RHOA2, 3ENST00000418115.1
SF3B113 - 16ENST00000335508.6
SOCS12ENST00000332029.2
STAT319 - 21ENST00000264657.5
STAT5B14 - 17ENST00000293328.3
STAT612 - 18ENST00000300134.3
TCF316 - 18ENST00000344749.5
TET23 - 11ENST00000380013.4
TNFAIP32 - 9ENST00000237289.4
TNFRSF141 - 8ENST00000355716.4
TP532 - 11ENST00000269305.4
TRAF22 - 11ENST00000247668.2
XPO115, 19ENST00000401558.2

Volgende regios hebben frequent (in >30% van de stalen) een verminderde gevoeligheid. Deze bevatten geen hotspot mutatie:
BIRC3 Exon 6, CD79A Exon 4, CREBBP Exon 11 en 21, JAK3 Exon 13, TRAF2 Exon 6

Tarificatie

Nomenclatuur:
535791 - 535802 B 1 NGS van chronische lymfatische leukemie
Bron: RIZIV website op 01/04/2025
535835 - 535846 B 1 NGS van T-lymfoblastische leukemie/lymfoom (T-ALL-T/LBL-T)
Bron: RIZIV website op 01/04/2025
535916 - 535920 B 1 NGS van T-“Large Granular Lymphocytic (LGL)” leukemia
Bron: RIZIV website op 01/04/2025
535931 - 535942 B 1 NGS van lymfoplasmacytair lymfoom/Waldenström Macroglobulinemie
Bron: RIZIV website op 01/04/2025
535953 - 535964 B 1 NGS van folliculair T-helper cel lymfoom
Bron: RIZIV website op 01/04/2025
588453 - 588464 B 3000 Opsporen van verworven chromosoom of genafwijkingen (met uitsluiting van immuunglobuline- of een T-celreceptorgenherschikking), door middel van een moleculair biologische methode : in de diagnostische investigatiefase van een chronische lymfoïde aandoening (non-Hodgkin lymfoom, chronische lymfatische leukemie, multiple myeloom), exclusief een acute leukemie, Burkitt's lymfoom of T- of B- lymfoblastisch lymfoom en refractaire anemie mey blastnoverproductie (RAEB) (Diagnoseregel 1, 6)
Bron: RIZIV website op 01/04/2025

Laatst gewijzigd op

Glims system
31-03-2025
global