De ziekte van Whipple is een zeldzame infectieziekte die wordt veroorzaakt door de bacterie Tropheryma whippleii. Deze bacterie kan op allerlei plaatsen in het lichaam ontstekingen veroorzaken. Een infectie begint meestal in de dunne darm en breidt zich uit naar de rest van het maagdarmkanaal. De ziekte kan zich ook verspreiden naar -onder andere- gewrichten, longen, hart, lymfeklieren, hersenen en ogen. Tropheryma whipplei komt echter ook bij gezonde mensen voor. Mogelijk vindt bij zieke personen een afwijkende reactie van het immuunsysteem tegen deze bacterie plaats waardoor ontstekingen ontstaan. De ziekte van Whipple is niet besmettelijk van mens tot mens.Tropheryma whipplei kan niet worden gekweekt in routineomstandigheden. Bij vermoeden van de ziekte van Whipple kan Tropheryma whipplei worden opespoord door middel van moleculaire diagnostiek (PCR). Preferentieel wordt PCR uitgevoerd op biopten van aangetaste organen (darm, hartklep, ...) of op CSV. Eventueel kan screening op faeces (speeksel) worden overwogen indien een invasieve procedure niet is aangewezen. Een negatieve faeces screening heeft een vrij hoge negatieve predictieve waarde. Opsporen op bloed wordt niet aangeraden omwille van de lage sensitiviteit (<10%).