Correct en onbeschadigd recipiënt met duidelijke identificatiegegevens. Enkel monsters met een positieve HCV virale lading worden aanvaard. De virale lading dient op de aanvraagbrief vermeld te worden. Indien niet gekend, dan kan een kwantitatieve HCV test bij worden aangevraagd.

Nanopore sequencing van een deel van het variabele NS5b gen. Na RT-PCR wordt het fragment gesequenced op een Nanopore MinION en worden de gegeneerde sequenties geanalyseer met gespecialiseerde software voor virale genotypering.

HCV is erg heterogeen. Minstens elf HCV genotypes met tal van te onderscheiden subtypes werden geïdentificeerd doorheen de wereld. Deze diversiteit heeft verschillende consequenties: hoewel de verschillende stammen blijkbaar niet dramatisch onderling verschillen wat betreft hun virulentie of pathogeniciteit, zullen de diverse genotypes toch een variatie vertonen in hun mate van antwoorden op combinatietherapie met interferon/ribavirine gebaseerde schemas. Daarenboven hindert de uitgesproken heterogeniciteit binnen HCV de ontwikkeling van een werkzaam vaccin. Vaccinale antigenen van multiple genotypes zullen noodzakelijk zijn voor globale protectie.