Lange tijd tussen afname en inbrengen van de flessen in het toestel kunnen vals negatieve resultaten geven. De flessen van langzaam groeiende micro-organismen moeten langer dan 5 dagen geincubeerd worden. Monsters worden bij voorkeur afgenomen bij patiënten die niet onder antibioticatherapie staan.

De resultaten moeten geverifieerd worden aan de klinische toestand van de patient; de aanwezigheid van coagulase negatieve stafylokokken, viridans streptokokken en andere huidflora uit 1 enkele afname wijst vaak op een besmetting van het bloed tijdens de afname. De aanwezigheid van gisten en Gram-negatieve bacillen zijn steeds als significant te beschouwen en moeten behandeld worden.